Năm 1210, khi nghĩa trang liền kề hết chỗ, người dân nơi đây dựng một căn phòng để cất giữ xương. Sau đó, vào năm 1269, nhà thờ được xây dựng. Đến năm 1712, nó đã bị phá hủy trong một đám cháy.

Nhà thờ cũ được tái tạo và mở rộng thành nhà thờ Saint Bernardino alle Ossa như ngày nay. Khi vào nhà thờ, điều hấp dẫn du khách chính là những bộ xương xếp chồng lên nhau, ốp thành các bức tường.

Hơn thế nữa, những bộ xương còn dùng để trang trí những hốc hay trụ cột theo phong cách Rococo - phong cách kiến trúc tập trung vào những đường nét họa tiết trang trí. Phần lớn xương ở đây là của các nạn nhân dịch hạch thời Trung Cổ. Số còn lại có thể được quy tập từ các nghĩa trang trong thế kỷ XVI.

Một số hình ảnh về nhà thờ San Bernardino alle Ossa: